L'Institut national de la santé Ricardo Jorge (INSA) étudiera consécutivement des échantillons positifs de patients présentant une infection covid-19 «anormalement longue» pour essayer de comprendre la situation et être en mesure de «soutenir la décision clinique et de santé publique».

«L'existence de nombreux cas d'infections inhabituellement longues (supérieures à 3-4 semaines), identifiées en laboratoire par la persistance de résultats positifs, a été une préoccupation pour les établissements de santé en raison de la nécessité de maintenir un confinement prolongé des personnes infectées à l'hôpital ou à domicile. », Précise l'INSA dans un communiqué publié sur son site Internet.

Pour tenter de comprendre cette situation, l'INSA mènera une étude sur l'intégrité génétique du coronavirus SARS-CoV-2, responsable de la maladie du covid-19, et son évolution au cours de la période d'infection dans le but de «soutenir la décision clinique et la santé publique ».

La recherche "étudiera une série d'échantillons positifs consécutifs de patients présentant une infection anormalement longue, les soumettant à des études d'intégrité génomique en utilisant la méthodologie de séquençage de nouvelle génération".

Selon le chercheur João Paulo Gomes, coordinateur de ce projet, l'étude entend comprendre si «le génome viral du SRAS-CoV-2 est« entier »» ou si seuls de petits fragments viraux non infectieux sont détectés, en utilisant la même méthodologie que il est utilisé dans l'étude nationale de la variabilité génétique du SRAS-CoV-2, également dirigée par l'INSA.

Parallèlement, l'infectiosité virale de certains de ces échantillons tardifs sera également étudiée par culture de lignées cellulaires.

"Ces résultats nous permettront de comprendre si nous sommes confrontés à un scénario d'évolution génétique adaptative du virus, permettant la persistance de l'infection, ou si les derniers échantillons positifs ne traduisent pas plus que l'existence de fragments viraux non infectieux", explique João Paulo Gomes dans le communiqué.

Le chercheur affirme que, si cette dernière hypothèse est confirmée, des bénéfices directs et immédiats sont attendus pour le National Health Service, car des preuves scientifiques seront fournies à deux organes décisionnels.

«D'une part, aux cliniciens sur la possibilité de sortir les patients avec détection de la présence du virus dans les échantillons respiratoires pendant de longues périodes. D'autre part, aux médecins de santé publique sur la possibilité de lever la restriction des contacts sociaux aux personnes infectées confinées à domicile », explique-t-il.

Le coordinateur du Nucleus of Bioinformatics de l'INSA souligne que «en conséquence, les impacts respectifs au niveau familial, social et économique sont naturellement prévus».

Pour le développement de cette étude, l'INSA compte non seulement avec sa vaste collection d'échantillons positifs analysés, mais aussi avec la collaboration spécifique des laboratoires d'analyses Unilabs, Synlab et Joaquim Chaves.

Dans le cadre de ce projet, qui a obtenu un financement de 34 milliers d'euros et durera six mois, une collaboration scientifique a été initiée avec l'Instituto de Medicina Molecular, qui permettra d'utiliser des approches complémentaires dans le même but, afin que les conclusions ont la force nécessaire aux fins cliniques et de santé publique auxquelles elles sont destinées.

Le projet est financé dans le cadre de la deuxième édition du programme de soutien «Research4Covid», promu par la Foundation for Science and Technology.

La pandémie de Covid-19 a déjà causé 1 534 décès au Portugal et 39 392 cas d'infection confirmés, selon les dernières données de la direction générale de la santé.

HN // JMR