Une étude sur la diversité génétique du coronavirus SRAS-CoV-2 a détecté trois nouvelles variantes du virus circulant dans la deuxième vague de la pandémie de covid-19 au Portugal, un chercheur de l’Institut national de la santé Ricardo Jorge (INSA) s’est rendu à Lusa aujourd’hui.
L’un des trois variants représente environ 70% des génomes viraux analysés dans l’étude et qui se caractérise par «une mutation très spécifique» qui affecte les régions où les anticorps se lient.
«Nous avons maintenant vérifié dans cette étude que nous l’avons fait en collaboration avec le Gulbenkian Institute of Science [IGC] que les variantes qui caractérisent cette seconde vague au Portugal ont des mutations qui n’ont pas été décrites tout au long de la première vague », a déclaré João Paulo Gomes, responsable de l’unité de bio-informatique du département des maladies infectieuses de l’INSA.
Les trois variantes les plus fréquentes, chacune reconnue par un changement différent de la protéine Spike (A222V, S477N ou S98F), ont été détectées dans toutes les régions du Portugal continental, suggérant qu’elles étaient les principales co-responsables de la deuxième vague épidémique de SRAS-CoV -deux.
Le coordinateur de l ‘«Etude de la diversité génétique du nouveau coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19) au Portugal» a expliqué que cette situation résulte «d’un processus d’adaptation du virus à l’homme».
«C’est normal que cela se produise, cela fait un an que le virus semble infecter les humains, donc c’est parfaitement normal», a-t-il déclaré, illustrant que «la variante britannique qui est apparue maintenant en est une de plus et ne sera pas la dernière, malheureusement », et cela suscite des inquiétudes.
Concernant les mutations observées dans le pays, le chercheur a déclaré que certaines « sont assez intéressantes », mais ne sont pas exclusives au Portugal, soulignant que « l’une des mutations caractérise une variante apparue en Espagne il y a quelques mois et qui s’est répandue dans le reste de l’Europe pour une vitesse incroyable »et qui était maintenant observée au Portugal dans 70% des échantillons analysés dans l’étude
Interrogé pour savoir si cette variante est plus létale et peut expliquer l’augmentation des cas dans la deuxième vague, le chercheur a déclaré qu ‘ »en termes cliniques, il n’y a pas de preuve d’une plus grande gravité en termes de maladie ».
L’augmentation des cas peut être justifiée par l’existence de variantes génétiques avec une plus grande capacité de transmission, mais le chercheur considère que le comportement social est à la base du plus grand nombre de cas de la deuxième vague dans le monde.
«Lors de la première vague, nous avons observé des mesures de restriction plus sévères qui permettaient un meilleur contrôle, maintenant nous ne l’observons plus car à la fin de la première vague il y avait un manque général de définition et nous ne sommes jamais retournés à un véritable confinement» car «ce serait très difficile de le faire «Pour des raisons économiques, sociales, familiales
Selon le rapport d’étude, publié aujourd’hui, 2234 séquences du génome du SRAS-CoV-2, responsable de la covid-19, ont été analysées à ce jour, obtenues à partir d’échantillons collectés dans 68 laboratoires, hôpitaux, institutions, représentant 199 municipalités de Le Portugal.
Dans cette mise à jour de l’étude, 449 autres séquences du génome du SRAS-CoV-2 ont été insérées, collectées depuis début novembre dans 19 laboratoires / hôpitaux collaborateurs à travers le pays, représentant 16 districts du continent et des Açores, dans un total de 113 municipalités. .
Sur le nombre total de virus séquencés, aucun virus n’a été trouvé avec la combinaison de mutations présentées par le variant actuellement en circulation au Royaume-Uni ou par les variants associés aux foyers de SRAS-CoV-2 dans les élevages de visons au Danemark.
«Fait intéressant, la variante génétique qui a marqué la première vague de l’épidémie de covid-19 au Portugal (avec la mutation dans Spike D839Y) n’a pas été détectée dans les génomes analysés dans la deuxième vague. Cela suggère que les mesures de santé publique mises en œuvre auront atténué la poursuite de leur transmission », souligne le document
La pandémie de covid-19 a déjà fait près de 1,7 million de morts dans le monde depuis décembre de l’année dernière, dont 6 254 au Portugal.
HN // HB
Lusa / fin
